تأسست كلية الصيدلة سنة 1975 ف ، بموجب قرار من مجلس قيادة الثورة آنذاك .. وقد جاء تأسس هذه الكلية في وقت كان المجتمع فيه بأمس الحاجة لهذه المؤسسة ، وذلك لمواجهة متطلبات مرحلة التحول الثوري ومساهمة في رفع من مستوى الخدمات الطبية للمواطن بالجماهيرية والبدء جديا في أعطاء دفع قوي لمجال الخدمات الدوائية والدخول في هذا المجال على أسس علمية ..

الآن وبعد مضي أكثر من ربع قرن على مولد هذه القلعة العلمية والتي هي من إحدى إنجازات شعبنا العظيم بفضل ثورته العظيمة ، والتي زودته بشباب مؤهل ومؤمن بدوره في مجتمعه ليقود مجالات الصناعة والرقابة الأدوية والتحاليل الطبية وترشيد استعمال الأدوية والاستفادة القصوي من الأعشاب والنباتات الطبية .

بدأت الدراسة بالكلية مع بداية العام الدراسي 1975- 1976 ف .. واستمرت الدراسة بالمبنى القديم والذي تشغله الآن الجامعة المفتوحة .. وفي العام 1983 ف , تم أبرام عقد إنشاء مبني جديد لكلية الصيدلة بجامعة الفاتح .. وقدتم بناؤه على مساحة تبلغ أربعين آلف متر مربع "40.000 م² " جنوب جامعة الفاتح ..

كما يعتبر مبنى الكلية من أجمل مباني الجامعة حيث تم اختياره كإحدى أجمل المباني في العالم .. ويحد الكلية من الناحية الشرق كلية الطب البشري لتشكلا مع مركز طرابلس الطبي نموذجاً متميزا للجامعة الطبية التخصصية .

هذه المؤسسة لا تنسي أبنائها حيث حيث لازالت ترعاهم استقبلتهم طلابا فأحسنت إعدادهم ، وتخرجوا منها ولم ينسوا هذا الصرح الحضاري العظيم ، فبذلوا الجهد وتغلبوا على الصعاب من اجل النهوض بها ..